useR

El paquete de R: isocir. Inferencia Isotónica con Datos Circulares resolviendo problemas de la Biología Molecular


Sandra Barragán Andrés (Universidad de Valladolid), Cristina Rueda Sabater (Universidad de Valladolid),
Miguel A. Fernández Temprano (Universidad de Valladolid), Shyamal D. Peddada (National Institute of Environmental Health Sciences, USA)


El paquete de R isocir ofrece un conjunto de funciones para hacer inferencia isotónica con datos circulares. La estimación de parámetros circulares ordenados entre sí es una cuestión de gran interés para muchos investigadores. Los métodos usuales, que han sido desarrollados para el espacio Euclídeo, no pueden aplicarse directamente en los datos circulares. En concreto, ante la presencia de restricciones entre los parámetros, estimadores y test de hipótesis tienen que ser definidos apropiadamente para tratar las peculiaridades de los datos circulares. Con una motivación inicial en la resolución de problemas de biología molecular, introdujeron la noción de orden isotrópico y desarrollaron una metodología para la estimación de parámetros circulares bajo restricciones. Dado el reciente interés entre los biólogos por identificar los genes del ciclo celular que se conservan entre diferentes especies, desarrollaron una metodología para tratar con problemas de contraste isotrópico. En el paquete de R isocir se encuentra la implementación de todos estos métodos para poder ser usados en cualquier contexto donde aparezcan datos circulares con restricciones de orden.
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