Paquete de R ``alteredExpression'': algoritmo para localizar genes con perfil de expresión alterado por una enfermedad.
José Manuel Sánchez Santos, Universidad de Salamanca
María Jesús Rivas López, Universidad de Salamanca
Carlos Prieto Sánchez, Centro de Investigación del Cáncer de
Salamanca
Jesús López Fidalgo, Universidad de Castilla-La Mancha
Javier de Las Rivas Sanz, Centro de Investigación del Cáncer de
Salamanca
Muchas de las herramientas sobre expresión génica buscan genes
diferencialmente expresados entre 2 grupos de individuos (control,
paciente). Sin embargo, los mecanismos moleculares de una enfermedad
producen frecuentemente des-regulaciones que dan lugar a alteraciones
grandes en el nivel de expresión del gen. Basados en esta observación
biológica, el algoritmo incluido en el paquete de R
``alteredExpression'', localiza grupos de genes que presentan una
alteración significativa de la variabilidad de sus perfiles de
expresión entre controles y pacientes, es decir, identifica genes cuyo
perfil de expresión está alterado por el estado patológico enfermo
(http://bioinfow.dep.usal.es/AlteredExpression).
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